Edward et Alphonse Elric sont de retour à Dublith, auprès de leur maître Izumi Curtis afin de parfaire leur entraînement et leurs connaissances de la transmutation humaine. Ils sont rapidement mis sur la piste d'un dangereux manuscrit, autrefois interdit de publication, qui pourrait bien contenir le secret pour leur faire recouvrer leur apparence d'origine.